Есть ли возможность интегрировать блютуз метку в штатный брелок сигнализации?

Ничего невозможно нет в принципе. Но если включить разум, то  ответ станет очевиден - чтобы еще что-то втолкать в корпус ШТАТНОГО брелока - под это ЧТО-ТО в нем должно быть место. ПУСТОЕ место. А его там нет, как нет штатного брелока в комплекте сигнализации S96. Поэтому возникает встречный вопрос - что Вы подразумеваете под "штатным брелоком сигнализации"?

Если Вы имели в виду КЛЮЧ от автомобиля, так и там лишнего места тоже нет. Это с одной стороны,  а с другой - там, в корпусе уже есть радиопередатчик  и как он себя поведет при появлении в нескольких миллиметрах от него ЕЩЕ ОДНОГО передатчика  и не начнут ли они создавать друг другу помехи - вопрос вопросов (даже если в корпусе ключа найдется место).

.Но есть факт например как это понять на сайте пишут что связи с маяком нет а на карте есть положение в виде стрелки и она двигается.?

Возможно всё дело в 

Координаты присылает через час а может через три часа

Но нередко всё куда проще - маяк слишком глубоко запрятан в железо автомобиля

Сам прибор не плохой работает даже под железом чувствительность хорошая

Положите свой сотовый телефон на дно железной кастрюльки с хорошей плотно прилегающей крышкой, закройте крышку и попробуйте позвонить на него - ответом скорее всего  (если кастрюлька реально с плотно прилегающей крышкой) будет "абонент не абонент". В машине не всё так печально, но чем ближе GSM-антенна к металлу кузова, чем металла больше вокруг неё и если не дай бог она ПОД металлом - например маяк на стяжках снизу трубы-усилителя в недрах торпедо или  в верхней крышке торпедо в пластик замуровано металлическое армирование - стабильной связи не жди. Радиоволны - они такие - им свободу для прохождения подавай...

Треки маршрутов корректно рисует?

Сначала надо найти - куда РЕАЛЬНО подключен серо-черный. Разобраться -что в этой точке проводки происходит. Далее или выставлять в настройках походящий вариант   настройки под это подключение (если там ХОРОШИЙ сигнал) или для начала ПЕРЕПОДКЛЮЧАТЬ серо-черный, а уже потом изменять(или не изменять) настройку в соответствии с переподключением. Чего бес толку из пустого в порожнее переливать... 

быстро садится батарейка 7-10 дней, потом открывается при нажатии раза с 10

Если  речь про элемент питания в метке, то в комплекте стандартной S96v2 (не ЭКО-вариант) их должно быть ДВЕ. Установите элемент питания во вторую метку и проверьте  её работу. Если ей еще ни разу не пользовались - после установки элемента питания и сборки корпуса метки сделайте 5-7 быстрых нажатий кнопки на её корпусе  - активируйте метку - чтобы в последующем при однократных нажатиях кнопки на метке - контрольный светодиод в метке вспыхивал зеленым и ЦЗ машины запирался-отпирался (охрана включалась-выключалась)...

Если  со второй меткой  батарейка будет жить как минимум несколько недель (в идеале - несколько месяцев), а для проверки проживет  пару-тройку недель без замены батарейки и продолжит без проблем работать, то проблемную метку надо сдать на ремонт в ближайший сервис-центр Ультрастар  https://www.starline.ru/service-centers/

Если и во второй метке элемент питания сядет также быстро, то или Вы покупаете  элементы питания где попало и сомнительного качества или у Вас какие-то проблемы с системой охраны (какие именно - по интернету непросто будет выяснить)... С этим лучше по месту установки разбираться.

Так же часто пропадает связь с авто, через приложение, смс, звонки не получается управлять.

На скриншоте  при запросах  уровень сигнала GSM только один раз был ниже 20 (выше 20 - это отличный сигнал и связь просто обязана быть). При меньших значениях управление уже может сбоить, а при уровне меньше 15 быть очень неустойчивым. Ну и разумеется - при уровне около нуля - не быть вовсе. При грамотном размещении главного блока  и хорошем покрытии сетью сотового оператора - такого быть не должно. Значит или Вы периодически сами находитесь в таких местах, где Ваш телефон  в зоне плохой связи, или машина стоит в таком месте, что её GSM-канал не может связаться с сотой... Ну или Вам  главный блок в машину установили без учета дополнительных требований к его размещению - слишком близко к металлу и слишком глубоко в недра машины.

Вот тут https://support.starline.ru/ru/communities/10/topics/7000-a94-problema-s-dy-2-dopdatchik  красочно описано - как НЕПРАВИЛЬНО и что делать для исправления. Это уже по месту установки надо решать.

Если систему охраны установили именно Вы, коллега, то Вам и разбираться - что именно не так. На что обратить внимание - написано выше.

Если укажете марку-модель-год-тип КПП-чем заводится машина и сбросите сюда файл текущих настроек (тот, что с расширением .slc), то  может быть появятся еще идеи - что посмотреть или что изменить в настройках...

основная колодка Mini-Fit Шаг 4,2 mm.  У датчика GPS, могу ошибаться, но похоже на JST PH2/

Чуть-чуть ошиблись . Но близко. Очень близко.

Судя по всему основная колодка всё таки не МИНИ,  а МИКРО, то есть  molex  micro-fit (шаг 3мм) Ну и кол-во пинов надо добавить https://www.molex.com/molex/products/family/microfit_connector

 а у  GPS разъем пятипиновый  (разъем PH5/)  , а не двухпиновый  PH2.  НО ГЛАВНОЕ верно : серия JST

то есть полное название  JST PH5/  

)))))вот и думаю а смысл мне брать ещё одну сигналка с CAN если все надо переключать на аналог))))))да и эту зачем тогда брал.

Ну тогда почитайте еще кое-что.

https://support.starline.ru/ru/communities/10/topics/7000-a94-problema-s-dy-2-dopdatchik

CAN- не волшебство и не панацея. Это один из (ОДИН  ИЗ) из возможных , но НЕ ЕДИНСТВЕННЫХ  способов подружить сигнализацию с машиной. Благодаря ему Вам не пришлось как минимум  устанавливать в машину ЧИПово-ключный обходчик и "хоронить" в нем один из ключей (а возможно еще и ЧИП дописывать в мозг мотора, если ключ единственный) - если маши на с иммобилайзером.   И машина маши не рознь. В каких-то  (особенно если в них еще и иммобилайзера нету) вполне можно обойтись без CAN-адаптера, а в каких-то - без него будет не менее  "веселее", чем с ним... Читаем еще раз, только ВДУМЧИВО читаем  написанное мною (и не только мною) на Алармфоруме и по ссылкам, что там есть...

Непростое это дело - современную сигнализацию подружить с современной машиной. Много про что знать и помнить надо. В том числе и про ОСОБЕННОСТИ работы  шины CAN. А так же не ждать от неё волшебства, особенно при использовании  прошивок, не тестированных на определенной комплектации машины,  отличающейся от  той,  которой прошивка предназначена. И с пониманием относиться к тому, если что-то не заработает сразу же или откажет со временем на этой не родной прошивке. Конечно можно пытаться обновлять прошивку, шаманить в настройками сигнализации и это тоже может принести плоды (а может и не принести). Я  предложил Вам гарантированный путь решения проблемы. Вам решать - как поступить.

По поводу рекомендаций спасибо конечно,но я думал именно эта ветка форума для этого и создана что бы обсуждать САМОСТОЯТЕЛЬНУЮ установку.

Читаем правила форума https://support.starline.ru/ru/knowledge-bases/2/articles/19670-pravila-foruma особенно внимательно  - п2.7.

ремень отстегнут,

Спасибо за уточнение На многих марках-моделях машин при застегнутом ремне  и заведенном моторе  ЦЗ не работает

ЦЗ управляется по CAN,

Работа функционала проверялась на машинах Российского рынка. Никто не гарантирует его правильную и длительную работу  на машинах других рынков. Это написано в описании прошивки CAN на оранжевом фоне для привлечения внимания.

а как же оно год работало?

ЧУДОМ. Если хотите, чтобы гарантировано продолжило работать дальше - делайте аналоговое подключение.

Еще я бы рекомендовал (чтобы не лазить второй-третий -четвертый раз для переделки) заодно переделать  контроль зажигания, тормоза, а при возможности и "мотор заведен" (если найдете в проводке машины  хороший сигнал для  него) на аналоговое подключение.

Почему и зачем?

Подробности ТУТ

https://www.alarmforum.ru/forum55/thread15807-3.html (читаем не одну страницу, а все, а заодно и обнаруженные там ссылки тоже).

Что касается

Ситуация такая,висел на поесе допбрелок я оперся на него и он запищал вместе с машиной и тут началось,

то  есть хорошее правило - "после того - не всегда в результате того"

И еще - раз установка самостоятельная - не удивляйтесь, если модераторы перенесут Ваш вопрос в соответствующий раздел - раздел  для самоустановщиков.

Так вроде нет никакой проблемы. Просто есть  разные алгоритмы работы этого реле в зависимости от ВАРИАНТОВ ПОДКЛЮЧЕНИЯ и НАСТРОЕК.

Как настроить, чтобы двигатель глох после постановки на охрану

А машина что - с МКПП?

Если НЕТ (машина не с МКПП, а  с АКПП/CVT), то непонятно - зачем делалась поддержка зажигания при покидании автомобиля.

Если ДА (машина с МКПП), то самое правильное - обратиться по месту установки сигнализации. Для изменения этой настройки требуется подключение к сигнализации ноутбука с программой StarLine МАСТЕР (это надежнее, чем МОБИЛЬНАЯ версия программы для смартфонов, но потребует разборки салона авто для доступа к блоку сигнализации) и умение этой программой пользоваться... Случайно натыкав в настройках не то - можно добавить проблем...

Странно, что установщики не оговорили с Вами вариант завершения программной нейтрали еще до установки системы охраны. Должны они были обсудить и ряд других моментов в работе системы...

Возможно - у сигнализации включен  сервисный режим ВАЛЕТ.  В этом режиме не управляется охрана,  не работает автозапуск, не активируются блокировки против угона. 

Попробуйте отправить команду 50 (это отключение сервисного режима). Если команда пройдет - попробуйте отправить команды 11  и 21 ( и 10, 20) после этого.

Кстати - до отсылки  команды 50 попробуйте позвонить на номер системы и послушать - что она скажет  в ответ?  Может там что-то будет про СЕРВИСНЫЙ режим? И кстати - команду 50  (как и любые другие) можно  набирать  тональным набором в процессе такого звонка на систему.

Интернет-приложение "телематика" в телефоне установлено? Что происходит при попытке управлять через него?