Your comments

1.Про годы выпуска - я имел в виду ПРОСТО "HOVER", без привязки к  конкретным H1...H10.
2. По настройкам - сами они не изменяются (я пока не сталкивался). Скорее всего Вы все-таки лАЗИЛИ в настройки, но СПУТАЛИ или пункты или ТАБЛИЦЫ (второе чаще случается, но там только 16 пунктов ).
Так что надо вернуть, как бУло и пробовать снова с ПОЛНОЙ ДИОДНОЙ РАЗВЯЗКОЙ, как посоветовал "Зорик Алибасович".
3. Вход контроля багажника ОТДЕЛЬНЫЙ и смена полярности на нем не предусмотрена (там всегда МИНУСвход), хотя на тех же ФОРДах надо бы ПЛЮС. Грамотные установщики делают инвертор на одном транзисторе. Дело 15-20 минут с паяльником. ВАМ ЭТО НЕ НАДО. У Вас - МИНУС на концевиках при открытии зоны охраны.

И если надоест бороться с проблемой - обратиться к профессионалам ВЖИВУЮ. Не к проводокрутам (уверенным, что "УСТАНОВИТЬ сигнализацию"="прикрутить её провода к проводам машины"), а к ПРОФИ, понимающим - что они делают и, главное,  - зАЧЕМ...
Я все разжевал ДОНЕЛЬЗЯ. Наберите в поисковике " свинцовые кислотные аккумуляторы" и читайте ВСЁ ПОДРЯД. Наверняка в научных трудах НАЙДЕТСЯ диаграмма или ГРАФИК связи НАПРЯЖЕНИЯ на клеммах аккумулятора И СТЕПЕНЬЮ его заряженности (остаточной емкости). НО НАДО ПОНИМАТЬ, что этот график справедлив ДЛЯ ИДЕАЛЬНОГО аккумулятора - выпущенного с соблюдением всех ГОСТов и ТУ, правильно ПРИВЕДЕННОГО (залитого кислотой и заряженного)  и еще НЕ ЗАМУЧЕННОГО эксплуатацией, особенно бЕЗГРАМОТНОЙ эксплуатацией. 
По мере старения аккумулятора ОРИЕНТИРОВАТЬСЯ на цифры напряжения на его клеммах МОЖНО, но с поправками на растущее внутренне сопротивление...
НАПРЯЖЕНИЕ - это единственный параметр, который можно ОЦЕНИВАТЬ электронными средствами НА КЛЕММАХ - СНАРУЖИ аккумулятора.

А главные процессы, влияющие на запуск мотора - протекают ВНУТРИ него. И их можно контрольровать только ПЕРИОДИЧЕСКИ, замеряя плотность электролита, проводя КТЦ, оценивая резервную емкость, определяя внутренне сопротивление в условиях "стационара" - мастерской/сервиса, где есть соответствующее оборудование и ГРАМОТНЫЙ диагност-автоэлектрик... 

Вам уже неоднократно СОВЕТОВАЛОСЬ - И З М Е Р И Т Ь ток потребления и уже исходя из этого ОПРЕДЕЛЯТЬСЯ - это аккумулятор уже на издохе и поэтому БЫСТРО САДИТСЯ даже при малых токах потребления или все-таки ПОТРЕБЛЕНИЕ слишком высоко и ВЫСАСЫВАЕТ "кровь" из еще пока  боле-менее ЖИВОГО аккумулятора ускоренными темпами.

Может все-таки ПОСЕТИТЕ  ГРАМОТНОГО автоэлектрика/диагноста/установщика сигнализаций на предмет - КАКОЕ ПОТРЕБЛЕНИЕ тока при выключенном зажигании в состоянии покоя (читаем подробности выше)?
Да, должна видеть, если в таблице настроек №1 (которая  отображается на экране брелока, как AF)  никто не изменил функцию №17 "полярность входа дверей" и она осталась в заводском значении (-) МИНУС.

Проверять надо не просто КАСАНИЕМ, а УДЕРЖАНИЕМ сине-черного провода на массе и нажатием кн.3 на брелоке - изменение индикации на экране  просходит после связи с блоком  сигнализации на борту. Мигающая дверка пропадет после отрыва провода от массы И СНОВА НАЖАТИЯ кн.3 (ну или любой другой).

PS Заколдованный какой-то автомобиль... Были у меня в работе 2011 и 2012гг. Проблем не возникло...
Спасибо. Буду знать (про шаблоны и их разрыв)!
Да, Андрей Мишагин,  посмотритет - что у Вас написано на плате  - просто CAN или 2CAN? Если не ошибаюсь - версии прошивок , начиная с 2.5 работают только с 2CAN...
Арман, здравствуйте. Вы уверены, что у Вас двери запираются от "ГАЗОВАНИЯ"? Не от набора скорости? Точно? Даже если стоять на месте с положением селектора КПП PARKING  завести мотор и ГАЗАНУТЬ - двери запрутся?
Ну тогда точно на автоВАЗе  идут своим путем все дальше...

1. У Вас запирает замки САМА МАШИНА, раз это завязано с педалью ГАЗА, так как такой функционал (запирание по оборотам двигателя) у сигнализации ТОЧНО ОТСУТСТВУЕТ.

2. Единственная настройка СИГНАЛИЗАЦИИ, связанная с АВТОМАТИЧЕСКИМИ запираниями/отпираниями замков - это СТРОКА 2 в таблице 1 (функция2 в таблице AF). Её Вы можете попробовать изменить самостоятельно. Для этого Вам понадобится ИНСТРУКЦИЯ по УСТАНОВКЕ вот  ОТСЮДА  , знание - где в автомобиле у Вас установлена кнопка ВАЛЕТ и ключ зажигания. Читаем инструкцию, разбираемся - как войти в настройки и для начала ПРОВЕРЯЕМ - какое значение выставлено в функции 2. Если выставлено значение 4 (на экране брелока будет 2-4), то могу предложить только варианты 1 или 2. Тогда у вас ХОТЯ-БЫ будет отпирание замков ПРИ ВЫКЛЮЧЕНИИ ЗАЖИГАНИЯ (и это за Вас будет делать уже СИГНАЛИЗАЦИЯ). А запирание теперь будет или по нажатию ТОРМОЗА перед включением передачи (если выбрать 2-1) или через 10 сек после включения зажигания (если выбрать вариант 2-2).

3. Для того, чтобы ОТКЛЮЧИТЬ запирание замков ПО НАБОРУ СКОРОСТИ ( или "газованию") - Вам придется посетить ДИЛЕРА или их сервис. Именно там озвучить свою просьбу. Не исключено, что это может и не отключаться даже там...

4. По модуля CAN-интерфейса Вы можете сменить САМОСТОЯТЕЛЬНО, если  не боитесь разбирать машину и блок сигнализации.  ВНИМАНИЕ!  Снимать платку  с надписью CAN-LIN нужно ПРИ ВЫКЛЮЧЕННОМ питании сигнализации. для этого достаточно выдернуть желтый предохранитель недалеко от блока сигнализации. 
Для обновления ПО Вам понадобится компьютер (он у Вас есть, раз сюда написали) и шнурок - USB-microUSB/
Ну и подсказки, озвученные  ТУТ  

Хотя, разумеется - ЛУЧШЕ, если все это сделает тот, кто это уже однажды (а лучше не единожды) делал. ТО есть ПРОФИ.

В любом случае - УДАЧИ.
Piletskiy, здравствуйте.
Задам  ДОПОЛНИТЕЛЬНО К СКАЗАННОМУ Сашей вопросы для размышления:
1. Стекло без нитей обогрева? Если подогреваемое, то антенну надо клеить в зоне бЕЗ НИТЕЙ ОБОГРЕВА с соблюдением правил пункта 2.
2. Как именно наклеивали модуль связи? От любой точки штыря антенны ДО : металла, шелкографии, тонировочной пленки, нитей обогрева (если они есть), других металлических частей ДОЛЖНО БЫТЬ не менее 5-6 см. Иначе неизбежна ЭКРАНИРОВКА радиоизлучения антенны И РЕЗКОЕ СОКРАЩЕНИЕ дальности связи.
Алексей, здравствуйте! Не совсем понятен вопрос... В настройках Е90 отсутствует возможность БЛОКИРОВАНИЯ отпирания багажника...
Багажник перестал открываться ШТАТНЫМИ органами управления? Или через сигнализацию  - нажатием комбинации кнопок БРЕЛОКА Е90? Или НИ ТАК, НИ ТАК не открывается?
Если знаете - то уточните для нас - как именно сделано было отпирание сигнализацией:
А) через CAN-шину,
Б) слаботоным управлением через штатную кнопку отпирания
В)  СИЛОВОЕ УПРАВЛЕНИЕ с установкой дополнительного реле и подачей +12 прямо на соленоид замка багажника

Не исключено, что проблема не в сигнализации, а в штатном электрооборудовании. Если есть возможность обратиться по месту установки сигнализации - это лучший вариант. Если такой возможности нет или вы не готовы  (НЕ ЖЕЛАЕТЕ) туда обращаться - ответьте на поставленные вопросы, чтобы стало понятнее - с чем именно у Вас проблема - со штатным оборудованием или с сигнализацией (или и с тем и с тем)...

После Ваших  УТОЧНЯЮЩИХ ответов кто-нибудь из специалистов, занимающихся установками обязательно ответит Вам  - в чем может быть проблема...
Sega, здравствуйте! Что означает "разрыв шаблонов"? Если не секрет, конечно...