То,  что приемо-передатчик теплый - это нормально.

А вот по  релюшкам - это ОШИБКИ ЗАПИТКИ обмоток реле С ПОСТОЯННОГО плюса, для реле блокировки. На охране они оказываются запитанными. надо с зажигания включать... Только реле управления  ЦЗ и багажника  - с постоянного плюса (так как на них управляющий сигнал поступает импульсно, а остальное время управляющий провод "в обрыве"... 

Подключить к кнонцевикам дверей БЕЗ этого реле. Судя по всему те, кто устанавливали сигнализацию - не обладали знаниями для этого... 
И интернета у них нету. Вот тут Ford Fusion  точки подключения. Схема вот тут МНОГО ИНТЕРЕСНОГО, хоть и про другую сигнализацию   на стр 25 ДЛЯ ПОЛОЖИТЕЛЬНОЙ ПОЛЯРНОСТИ  . Только Вам надо будет подключиться к СИНЕ-КРАСНОМУ проводу Вашей сигнализации из разъема Х3 ПЛАКАТ И еще  - диоды VD5...VD8 не обязательно устанавливать, разрезая для их установки штатные провода. Во всяком случае - СРАЗУ жЕ. Если заработает и без них и ложных сработок в течение месяца не будет - значит они "ЛИШНИЕ". Во всяком случае Фьюжены,  которых я сделал без этих диодов не вернулись на переделку.
С проводом багажника  - думайте. У Вашей сигнализации нет ВХОДА "багажник+" и значит либо с него  тоже диод цеплять на сине-красный или... спаять вот такую схемку КОНТРОЛЬ БАГАЖНИКА ФОРД

Ну как - ОСИЛИТЕ? Или все-таки найдете ФИНАНСЫ?
Предупреждаю сразу - некоторые электронные блоки в Вашем автомобиле стОят гораздо дороже  того, сколько возьмут за подтирание соплей за учениками, поставившими Вам сигнализацию С ОШИБКАМИ... А спалить их - даже не секундное дело - МГНОВЕННОЕ... 

Вам нужно ВЫПОЛНИТЬ УКАЗАНИЯ инструкции по установке. А именно то, что написано на стр 2   инструкции по установке Инструкция по установке . ред.10 (если у вас другая редакция, то СТРАНИЦЫ могут отличаться), далее  ВСЮ ИНСТРУКЦИЮ. ничего не пропуская. Особое внимание уделяя написанному на стр 20 И ДАЛЕЕ, особенно  - КРАСНЫЙ ТЕКСТ.
Вам уже дали совет - ВЫКЛЮЧИТЬ в CAN все статусы, которые вы подключили ПРОВОДАМИ. В первую очередь ТОРМОЗ и ПАРКИНГ...
Хотя, если не хотите проблем и дальше - я бы советовал еще и серо-черный повод сигнализации и желтый тонкий подцепить к проводке авто, а в CAN выключить чтение статусов ДВИГАТЕЛЬ ЗАВЕДЕН и ЗАЖИГАНИЕ включено - соответственно...

По поводу багажника - сымитировать гибкими каналами алгоритм штатных органов управления багажником. Для этого приборами (ВОЛЬТМЕТР,  МУЛЬТИМЕТР) измерить - что происходит в цепях штатных органов управления.
Концевик стекла - это что? микрик, на котором есть сиггнал , если стекло не закрыто? Но его нет в CAN?
Тогда:
а) выклчаем чтение концевиков в CAN,
б) тащим сине-черный С ДИОДНОЙ РАЗВЯЗКОЙ до всех концевиков дверей, и до этого концевика стекла.

По поводу ВЕБАСТЫ - прочитать описание на вебасту - куда иp её входов и  что надо подать для её запуска и каков ТОК входа. Если МАССУ надо подавать и ток меньше 100мА, то гибким каналом, если нужен ПЛЮС или ток больше - то на гибкий канал - РЕЛЕ, а его контактами - что надо и куда надо... 
Как-то так... Примерно...

СУДЯ ПО ВСЕМУ - дело не в сигнализации. Что-то случилось в проводке автомобиля... 
Советую внимательно осмотреть скрутки  в местах присоединения проводки сигнализации. Бывали прецеденты, когда ЖЕСТКИЕ проволочки жил проводов при зачистке перерезались и ТОРЧАЛИ ЁЖИКОМ. Со временем, проткнув изоленту - втыкались в соседние провода, образуя МОСТИКИ-коротыши. Возможно именно это у Вас и случилось. Вариант сложнее и длительнее - нечто подобное произошло в МОНТАЖНОМ БЛОКЕ. Это вААще ящик Пандоры на борту ВАЗа - каких только чудес я не насмотрелся по вине отгнивания дорожек в нем, отжигания  дорожек при коротышах в проводке, и собственно - замыканиях в нем же... Так что сигнализация ВПОЛНЕ МОЖЕТ БЫТЬ ни причем. 
Радость только одна - монтажный блок  - НА РАЗЪЕМАХ.
Вызовите ЗАВИСАНИЕ ЗАЖИГАНИЯ - как оно у Вас происходит. И  выдергивайте по одному разъему из монтажного блока. Как только выдернете тот,  после которого все погаснет  - следите - ЩЕЛКНЕТ-ли реле. Воткните его обратно -иповторите все сначала - точно он? - смотрите по схеме - как его провода могут быть связаны с реле, ищите, идите по цепям - где и что могло ЗАВЫЯЗАТЬСЯ. Бывает, что МАССА отваливается и потенциалы плавают в проводке - ДЛЯ ВКЛЮЧЕНИЯ реле мало, а дЛЯ УДЕРЖАНИЯ хватает...

Хотя быстрее будет к гРАМОТНОМУ АВТОЭЛЕКТРИКУ обратиться для лечения.

+1) для А91 другие варианты невозможны или трудно выполнимы...

Машины не помешают точно. Главное  - чтобы "лишних" глаз рядом не было. При записи брелоков Вы будете пользоваться кнопкой VALET. А она используется и для снятия охраны БЕЗ БРЕЛОКА. Подглядев - куда Вы лазите - потенциальные преступники будут знать о её местонахождении. И еще - все знают КОД 3 (ТРИ), установленный с завода для такого экстренного аварийного снятия с охраны. Советую сменить его НА ИНДИВИДУАЛЬНЫЙ код снятия с охраны этой кнопкой. ТОЛЬКО НЕ ЗАБУДЬТЕ потом - какой он у Вас. КАК это сделать? Все есть в инструкции...

По поводу КЛЮЧА В ЗАМКЕ - если Вы не СНЯЛИ при этом петлю-наброс, то:
1. блок управления двигателем при попытке пуска МОЖЕТ УВИДЕТЬ два ключа. Многие ЕВРОПЕЙЦЫ при таком раскладе БЛОКИРУЮТ запуск мотора, УВИДЕВ ДВА ЧИПа...
Это нонсенс - ДВА ключа в ОДНОМ отверстии. Это не по закону...
2. При попытках заводить ключом МОЖЕТ НАБЛЮДАТЬСЯ ШУНТИРОВАНИЕ и ослабление поля считывателя. Я ведь это все написал...
3. И ПРО ЧЕТКОЕ ДУБЛИРОВАНИЕ ЗАМКА ЗАЖИГАНИЯ тоже написал.
Если мы с Вами будем здесь препираться и что-то ДОКАЗЫВАТЬ друг другу - ничего не выйдет.
Проблема не решится. Нам отсюда не видать - ГДЕ ИМЕННО и В ЧЕМ Вы ошиблись. Именно Вы, а не мы.

А отсюда мы имеем возможность ПОДСКАЗЫВАТЬ и СОВЕТОВАТЬ - НА ЧТО обратить внимание. А уж слушать и ИСПОЛНЯТЬ (или НЕ ИСПОЛНЯТЬ) наши советы - Ваше право, но и Ваша обязанность. 
Поэтому ПЕРЕПРОВЕРИТЬ придется ВСЁ. Ну если Вас интересует ПОЛОЖИТЕЛЬНЫЙ результат, конечно.

Если хотите выяснить - что виновно - ОБХОДЧИК или ДУБЛИРОВАНИЕ замка зажигания, то ПРЕЖДЕ чем пробовать заводить с пульта сигнализации С ВОТНУТЫМ в замок зажигания ключом - СНИМИТЕ ПЕТЛЮ-наброс с замка. И воткните ключ ПРИ СНЯТОЙ петле-набросе.
Машина так ЗАВЕЛАСЬ через брелок? Замечательно, тогда Вытащите ключ, снимите  ШТАТНЫЙ считыватель ИММО с замка зажигания (если снимается) и поместите головку ключа в рамку считывателя. Если не снимается, то ПРИМОТАЙТЕ  ключ ГОЛОВКОЙ к замку, жалом в противоположную сторону от отверстия. Попробуйте так завести. И ТАК ЗАВЕЛОСЬ? Тогда копайте в сторону обходчика.
Если с воткнутым ключом ЗАВЕЛОСЬ, а с НЕ ВОТКНУТЫМ, но поднесенным к считывателю - не завелось и при этом значок ИММО НЕ МИГАЛ на табло в процессе прокруток стартера, то РАЗБИРАЙТЕСЬ - в чем разница  при воткнутом и не воткнутом (скорее всего есть контактная группа "ключ в замке" и её тоже надо имитировать - вот вам и два проводка, которые непонятны - смотрите - что на них происходит при втыкании/вытаскивании ключа). Если НЕ ЗАВЕДЕТСЯ ни так ни так  - РАЗБИРАЙТЕСЬ сначала С УЖЕ ПОДКЛЮЧЕННЫМИ проводами и программированием функции 7 во второй таблице настроек...
Ну а потом, когда найдете ошибку И УСТРАНИТЕ - все снова по кругу... Можно СРАЗУ с невоткнутым, а поднесенным ключом - если так ЗАВЕДЕТСЯ, то "ключ в замке" - ОТДЫХАЕТ и переходим к набросу обходчика. И тем не менее - советую разобрать его и проверить. Чтобы посреди зимы при ослаблении излучаемости ЧИПов не прилипнуть...

По поводу ОБХОДЧИКА - почитайте еще вот это КАК ПРАВИЛЬНО УСТАНОВИТЬ ОБХОДЧИК

+1) не только РУЧНИК, но и СТАТУС заведен/не заведен двигатель, и СТАТУС - зажигание включено при установке системы с функцией ЗАПУСКа МОТОРА  я лично ПРЕДПОЧИТАЮ СРАЗУ делать проводным подклчением. ВНЕ зависимости от того - заявлено чтение этих статусов из CAN или нет. Уже неоднократно были прецеденты (сначала на VW, а теперь и на других марках), когда проблемки с запусками начинались после посещения ДИЛЕРА для ТО. Там любят ОБНОВЛЯТЬ ПО (программное обеспечение) электроники на борту, а в результате - автозапуску КИРДЫК, если изменятся кодировки ВАЖНЫХ для осуществления этого самого запуска сигналов в CAN.
А вот РУЧНИК через концевик на массу ПРОВОДОМ  -  это железо и не зависит ОТ ПРОШИВОК,
Импульсы с форсунки или ДПКВ - как были, так и останутся, сколько ПО не меняй.
И появление +12 вольт на замке зажигания  - это тоже +12, а не "Unknown CODE"...

ЗАСЫПАНИЕ CAN-шины - это  отдельная темка для разговора...

ЛечиЦа. Нада АПхоТчик иММАбилайзИра прАверить... 
ЛуЧе, еслиВ (без обид на ПРАВОПИСАНИЕ)
это сделают ГРАМОТНЫЕ установщики сигнализаций. Самостоятельно соваться в обходчик, тем более на кнопочной машине, где он мог быть сделан САМОДЕЛЬНЫЙ - не надо. Станет только хуже...

Здравствуйте, Antiserj!
1. Вы использовали кнопку ВАЛЕТ Здесь фото КНОПКИ , ключ зажигания и брелок, а также написанное на стр.  34 и 36 ИНСТРУКЦИИ ПО УСТАНОВКЕ для СМЕНЫ температуры запуска? (Или установщик ПРОГРАММИРОВАЛ систему и менял эту температуру?) Или было оставлено ЗАВОДСКОЕ значение?
2. Если МЕНЯЛИ, то что показал брелок , когда Вы "запрограммировали"вариант функции 4?
На том месте, где обычно часы что было: 4_1 или  4_2?
Если об этом ничего не знаете, то

3. Сейчас, при активации третьей слева иконы в нижнем ряду - при ВКЛЮЧЕНИИ АВТОЗАПУСКА - что рисует брелок  после мелодии "тили-ли-ли лим" на том месте, где ЧАСЫ на брелоке? -5С или -10С?
Как активировать - надеюсь знаете (об этом в самом начале инструкции по эксплуатации - там где про курсорный способ - стр 20,21) и в конце - там, где описание АВТОЗАПУСКОВ стр 56 и далее...
Нет инструкции? Скачайте отсюда Описание А91 ( они в конце).