Дистанционного запуска с телефона нет? 

При записи первого брелка - 1 сигнал, при записи второго - 2, и так при записи каждого брелка

Смотрите питание основного блока, разъёмы. Где-то потерялся контакт при движении

По какой зоне была тревога, конечно, не увидели на ходу. Моргнула три раза, это перезагрузка. Нужно смотреть питание. Снимите минусовую клемму аккумулятора на 5 минут и оденьте в одно касание без искрения. 

После нажатия кнопок 1 и 2 на брелке был сигнал? 

Ну если проблема только с пассажирскими дверями, то смотреть нужно подключения к ЦЗ. 

Что мешает запустить двигатель и зарядить батарею, пока ещё можно это сделать? 

Сразу вопрос. Где брали сигналку и ставили, когда это было? 

Давно такое началось? При срабатывании тревоги, на ваш номер идёт звонок/смс? 

Нужно разговаривать с установщиком. Возможно, у него есть варианты обмануть сигналку и не прятать ключ.