Ваши комментарии

Может когда машина не заглохла, при дистанционном запуске, снимаете с охраны (двигатель работает), вставляете ключ , поворачиваете и едите и в этом случае не закрывается.

Так может это штатная сигнализация срабатывает?

Попробуйте снять еще и с штатного брелка.

Какой автомобиль?

Как подключено управление ЦЗ?

У Вас неправильно поставлены условия. 

При первом нажатии кнопки выполняется программа 1

при втором выполняется программа 1 и 2

при третье выполняется программа 1, 2, 3.

Условия необходимо построить так, чтобы программа выполнялась один раз.

Иначе Вы съедаете  ресурсы процессора.

Так какая часть программы не работает?

У Вас в условиях гибкой логике участвуют статусы которые сигнализация видит при включенном зажигании. 

Это статус паркинга, педаль тормоза ( ее вообще необходимо подключить по аналогу) и зажигание( тоже по аналогу).  Условие паркинга необходимо проверять когда включено зажигание. Во всех остальных случаях он может давать сбой.

Машина снята с охраны, при отсутствии метки двигатель должен запускаться или нет.

Зависит от настройки сигнализации.

При постановке на охрану стекла автоматически не закрываются, так должно быть?

Зависит от автомобиля и его комплектации.

Или ее с помощью программного обеспечения и компа или ноута надо менять.

только так

Это позволяет развиваться.

Я с Вами полностью согласен.

Но развития не наблюдается, эта проблема была озвучена больше года назад.

https://support.starline.ru/communities/80/topics/34375-toyota-premio-rhd-2007-2018-knopka-start-stop-beta-versiya#comment-200199

подскажите нужно ли пользоваться этими пунктами в принципе?

по Вашему желанию

значит по умолчанию стоит 3

да

Не должен, обратитесь по месту установки сигнализации.

Сервис поддержки клиентов работает на платформе UserEcho