изначально не закрываются стекла

Здравствуйте. Работа функции на Вашем автомобиле зависит не только от настроек, но и от подключений. Рекомендую посетить установщиков и уточнить: реализовано ли на Вашем автомобиле управление окнами?

Я нахожусь в г. Вологда и ехать в Питер к установщикам как-то не с руки может есть какой-то другой способ проверить?

Здравствуйте. 

Нужно проверить какие провода системы куда подключены.

Для этого рекомендую посетить установщиков. 

Позвоните в установочный центр. Если они не смогут подсказать по телефону, возможно, они отправят Вас к своим коллегам в Вашем городе.

Уточнял, через менеджера в автосалоне Автополе, он уточнял у своих установщиков, сказали что данная модель S9 типа не поддерживает данную функцию, и закрыть окна можно только удерживаю кнопку закр. на штатном брелке авто. Уж не знаю так ли то что S9  не поддерживает функцию закрытия окон при постановке на охрану, вроде элементарная функция, которая есть даже на допотопных сигналках, или просто они мне мозги канифолят и тупо физически где-то эту функцию не подключили. ПОдскажите есть ли физически данная функция в модели S9&

Здравствуйте.

вроде элементарная функция, которая есть даже на допотопных сигналках,

Работа функции зависит не только от охранной системы, но и от автомобиля. Не все так просто, как Вы представляете. 

StarLine S96 поддерживает закрытие окон по цифровой шине LIN. Об этом указано на сайте: https://can.starline.ru/28/15/8271

Если установщик не подключил провода LIN, то работать функция не будет.