Запуск по напряжению выше 12.5в

Литий все более популярным становится.

все еще значительно менее популярен чем стандартные аккумуляторы автомобилей. 

Ограничения сделаны для стандартных автомобилей в заводском исполнении. Таких машин абсолютное большинство. Ограничения позволяют исключить для установку неверных настроек на таких авто.

Для нестандартных машин с нестандартными АКБ доступны нестандартные решения на Гибкой Логике.

А что значит "на ГЛ собрать нужный запуск"?

Значит что установщик пишет программу. В ней в событии указывает нужное Вам напряжение. Хоть 16, хоть 20 вольт. Далее в действиях пишет "запустить двигатель". И все. получаете автозапуск по нужному Вам напряжению. Можно еще через переменные добавить кнопки включения - выключения этой программы.

Обсудите с установщиком Вашим.