Можно ли как-нибудь метку внедрить в ключ?

сомнительно. Вы разбирали метку ble? В вашем ключе не хватит места для платы метки. Да и вторую батарейку некуда вставлять, а одной батарейки на ключ и метку хватать будет максимум на неделю.

Здравствуйте. Подобных доработок не проводилось.

Если Вам некомфортно использовать метку, то можно настроить систему на работу вообще без метки. При этом сильно будет снижена стойкость системы к угону.