A93 и Шкода Кодиак

брелок сигнализации при открытии пишет, что снял с охраны, габариты мигают, но двери остаются закрытыми.

как раз ПОТОМУ ЧТО

При закрытии машины с ключа на центральный замок

Главные слова ТУТ  При закрытии машины с ключа и  брелок сигнализации при открытии

1) Штатные органы управления ЦЗ автомобиля имеют наивысший  приоритет  при управлении. Сигнализация - бедная родственница на борту.

2) Для решения  вопроса - а именно - чем бы машина ни была заперта - она отпиралась опять-таки чем угодно из имеющегося на руках- надо 

а) полноценно настроить SLAVE режим сигнализации, чтобы как минимум при постановке на охрану брелоком StarLine, а отпиранием кнопками на ключе - не орала сирена StarLine, а при обратной ситуации  ( запирание штаткой, отпитрание брелоком StarLine) - не орала штатка. Возможно - это всё-таки у Вас уже сделано и подобных тревог нету...

б) ПЕРЕДЕЛАТЬ управление центральным замком со стороны сигнализации - либо сделать АНАЛОГОВОЕ подключение каналов сигнализации  к  низовым цепям ЦЗ, либо переделать кодировку автомобиля  в части, касающейся управления ЦЗ. И в том и  в другом случае - без помощи спецов не обойтись. Чтобы сигнализация могла отпирвать машину, запертую НЕ ЕЮ...

Вам следует обратиться по месту установки для устранения недоделки  или к другим установщикам на доделку-переделку...