Мигание аварийки 4 раза

Возможно - это мигает не сигнализация, а ... сама машина... Потому что  мигания по четыре раза у сигнализации ШТАТНО предусмотрены только в случаях:

а) ПРИ ПОСТАНОВКЕ НА ОХРАНУ она что-то не может взять на охрану из зон охраны. При этом она еще и квакает ЧЕТЫРЕ раза, а не один (при условии, что сирена есть, подключена и исправна.)

б) ПРИ СНЯТИИ С ОХРАНЫ - так она сигнализирует, что за время охраны была не отбитая хозяином тревога. При этом она и квакает  не два раза, а на брелоке показывает ту зону, по которой была сработка.

С учетом 

Просто снимал клемы при ремонте авто, 

можно предположить, что возможно завис CAN-адаптер сигнализации, о наличии которого Вы ничего не написали (возможно - не знаете, что сигнализация была установлена с ним). Попробуйте еще раз снять клемму аккумулятора, выждать минуту и одеть клемму на место В ОДНО КАСАНИЕ - без искрения. Если не поможет, то

рекомендую обратиться по месту установки сигнализации и совместно с установщиками выяснить причину миганий.

Про Can адаптер не знаю, но клему попробую снять, может поможет) Спасибо за  совет! 

После выключения зажигания, сигнализация моргает аварийкой 4 раза.

Не поднят ручник. А63 или А93 стоит?

Нет, ручник не поднят. А93 эко

Поэтому и моргает. Ответ что нужно(если есть желание ) дан ниже

Здравствуйте. Похоже используется автозапуск и система сигнализирует об окончании поддержки мотора. Наверно не поднят ручник при этом. 

Если так, то нужно посетить установщиков и проверить настройки подхвата зажигания или оновить ПО центрального блока на S4 и выше.

Так и есть, ручник не поднят. Спасибо за  совет