Вопрос про брелки и метку

Установщики мне сказала, что только в ДОПОЛНИТЕЛЬНОМ брелке (который без ЖК дисплея) есть функция метки. Однако в инструкции написано, что они оба работают в этом режиме. 

Они не правы. Инструкция права. Так как у Вас сигнализация с приставкой 2CAN-2LIN, то значит - достаточно свежая. В ней оба брелока - метки. Это в первых версиях А93 меткой мог быть только доп. брелок...

Если оба брелка работают в режиме метки это означает, что я могу пользоваться любым из них? Или же установщики были права, а инструкцию я не правильно читаю.

Вы всё правильно читаете. Это во-первых. А во-вторых - никто не запрещает Вам провести эксперимент - сначала из одного брелока вытащить батарейку. Затем из другого.. Затем из обоих (после постановки на охрану!!!). И убедиться, что если хоть один брелок возле машины - StarLine   с охраны снимается при открытии машины кнопками на штатном ключе от машины.... А если нет ни одного (батарейки вытащены из обоих), то через 15-20-30 сек (сколько задано в настройках) начинается тревога. ВНИМАНИЕ!!! Если тревога не начнется и через  минуту, то значит УСТАНОВЩИКИ не настроили SLAVE как положено - с контролем метки!!! А тупо включили его (SLAVE) БЕЗ УСЛОВИЙ. И StarLine  послушно, как РАБ (SLAVE=РАБ) снимается с охраны. И весь диалог и шифры-коды коту под хвост...

Правильно ли я понимаю, что в случае снятия машины штатным брелком, идет отсчет времени на поиск метки (брелка) и если она не найдена - начинает кричать сирена. 

Правильно понимаете. Но только - если в настройках сигнализации SLAVE запрограммирован с контролем метки- брелока...