Starline A93 Авто не глохнет при постановке на автозапуск

Не могу поставить машину на автозапуск, делаю все по алгоритму, поднял ручник, выключил зажигание, достал ключ, нажимаю на первую кнопку, авто не глохнет, 

сигнализация не понимает, что Вы покинули машину - она не увидела факта открытия той двери, ЧЕРЕЗ КОТОРУЮ Вы вышли из машины.

выдает ошибку r99, 

Это не ошибка, это индикация, что подхват зажигания произошел и  максимальное время отсчета  работы двигателя 99 минут (реально в последних прошивках оно ограничено  30ю минутами)

концевики исправны ( на приборной панели все двери показывает верно ), заметил что на брелке не показывает все открытые двери кроме передней пассажирской и багажника, при открытии дверей диод не моргает, горит постоянно, если открыть и закрыть переднюю пассажирскую дверь, то авто глохнет и успешно ставится на автозапуск.

Сигнализация подключе на НЕ  КО ВСЕМ концевикам в машине. К которым подключена - те видит.

Или установщик "забыл" подключить, или что-то отгорело/отгнило/оторвалось в цепях подключения.

Надо чинить,устранять, восстанавливать.

вы сами ответили на свой вопрос. Нужно сделать так, чтобы сигналка видела все двери.