Издает звук брелок и мигает аварийка

Ставить заочные диагнозы - неблагодарное занятие - можно пальцем в небо ткнуть.

НО по  внешним проявлениям очень похоже или на пропадание-появление питания сигнализации или на начальный этап антиограбления.

Если в настройках сигнализации активирована функция антиограбления, то надо выключить и поездить с выключенной. 

 А по поводу  пропадания-появления питания - сделайте так:

при включенном зажигании в машине выдерните синий предохранитель на проводах сигнализации в 5-6 см от главного блока, подождите  секунд десять и воткните  предохранитель на место. Произошедшее ПОХОЖЕ на то, что происходит у Вас? Прям ну один-в-один? Тогда кроме Проверили массу была не много окислина , переделали 

проверяйте еще и красный провод сигнализации, на котором стоит как раз синий предохранитель - куда и как подключен этот красный и насколько там всё хорошо с контактом и нет-ли  стыков-соединений по дороге и не паяли-ли там с кислотой, хорошо-ли воткнуты фишки разъемов в блок сигнализации, особенно фишка Х2 с черным, красным и двумя полосатыми зелеными проводами (полосы желтая и черная). Ну и черный еще раз перепроверьте. Может плохо переделали или на нем тоже есть стык, который сгнил-окислился...

Похоже монтаж не особо правильно и качественно был произведен...

Ну вот - в небо пальцем я ткнул, а уж куда попал - выяснить сможете только Вы и тот, кто будет Вам  ВЖИВУЮ помогать НАЙТИ РЕАЛЬНУЮ ПРИЧИНУ...

Предлагаю обратиться к кому-нибудь из списка  https://www.starline.ru/x96partners/