Vw bora 1997 сигнализация A93 eco с отдельной CAN шиной

Подскажите что не так?

Фольксваген не самые простые машины для установки сигнализаций.

Что касается

Не корректно закрывает машину, багажник вовсе не закрывает.

выбран не самый лучший вариант подключения к цепям ЦЗ машины. В том месте , где это сделано - запирается не всё, что Вам хочется... Очень часто именно лючок бензобака и багажник остаются не запертыми... Как именно надо изменить  управление ЦЗ стороны сигнализации, чтобы заперлось всё - можно ответить. только поработав с машиной ВЖИВУЮ.

Так же при оставление машины заведенной на 20 мин,машина не закрывает замки,но на брелоки стоит на охране.

Включение охраны и запирание ЦЗ - это две большие разницы. И надо полагать  место подключения управлением ЦЗ со стороны сигнализации  выбрано архиневерно и оно не управляет ЦЗ ПРИ ЗАВЕДЕННОЙ МАШИНЕ. Потому и не запирается ЦЗ, если машина заведена. 

Надо переделывать... А чтобы переделать - надо  найти более верный вариант управления ЦЗ.

Учитывая направленность вопроса - модераторы могут перенести его в раздел САМОСТОЯТЕЛЬНАЯ УСТАНОВКА. Если он пропадет тут - его не удалили. Его перенесли.