прошивка 2can через gsm модуль?

Подскажите, возможно, что 2CAN модуль прошивается сам через gsm модуль? 

Нет.

Через программатор загрузил прошивку 4.0.3. в кан-модуль  Вставил в ЦБ сигнализации, после двух часов работы сигналки вынул кан-модуль, подключил снова к программатору и версия прошивки изменилась на 4.8.0

Скорее всего вы спутали версию библиотеки с версией прошивки, т.е., судя по скриншоту, залили прошивку 4.8.0 с библиотекой 4.0.2

Вот после прошивка файла "starline_2can_4-0-3_can_4-0-2.bin"

Версия программатора 2.10.2