постоянно горят поворотники

При автозапуске моргают, когда стоит ?

нет не моргает, когда стоит работает, только при запуске двигателя

в этом году после обновления ПО основного блока и блока canlin,...

1) Если не секрет - зачем обновляли?

Очень часто  действо под названием "обновление ради обновления" нередко вместо хоть какой-то пользы приносит вред. Ваш случай, похоже, из таких... Поэтому если всё работает и всё устраивает - НЕ НАДО затевать "обнову".

2) Если не тайна - а старые версии прошивок, которые были в блоке до обновы как были залиты в него - прямо из интернета из облака? Или были скачаны на комп, СОХРАНЕНЫ и только потом, уже из своего компа залиты в блок и модуль? То есть ВЕРНУТЬВСЁВЗАД  есть шанс?

1) программа предложила обновление, поэтому и обновил
2) есть названия версий прошивок с завода, t2 - осн блок, 1.0.11 - 2can2linv5, и получается что прошивку t2 неоткуда скачать, если есть возможность найти данную версию, можно вернуть все обратно
сейчас прошивка стоит sa04 t9 - осн блок,1.9.15 - 2can2linv5 обновлено по

поворотники как подключены? к какому каналу и как он настроен?

из блока сигнализации подключены к авто два провода зел-желт, зел-черн за поворотники в жгуте панели приборов

1) программа предложила обновление, поэтому и обновил

зря Вы это сделали...

2) есть названия версий прошивок с завода, t2 - осн блок, 1.0.11 - 2can2linv5, и получается что прошивку t2 неоткуда скачать, если есть возможность найти данную версию, можно вернуть все обратно
сейчас прошивка стоит sa04 t9 - осн блок,1.9.15 - 2can2linv5 обновлено по

Учитывая 

из блока сигнализации подключены к авто два провода зел-желт, зел-черн за поворотники в жгуте панели приборов

прошивку CAN можно пока не трогать, а вот прошивку главного блока надо или откатить  на Т4 или обновить до U7

пробовал, T4 и U7, без изменений,
ищу T2, если не найду то буду ставить T1, если и так ситуация не исправится, буду грешить на залипание реле внутри блока сигнализации

Неоднократно  при установках в машины  использовал прошивки Т4 и U7 с аналоговым управлением миганиями каналом 9. Никто из клиентов не приехал с жалобами.

Поэтому  вполне возможно, что 

грешить на залипание реле внутри блока сигнализации

не такая уж бредовая идея. Особенно - если  в настройках было задано 

"мигать всегда, мигать везде, до дней последних донца. Мигать. И никаких гвоздей. Вот лозунг мой и солнца." Владимир Маяковский (немного перефразированный, в оригинале было  СВЕТИТЬ, а не "мигать").

Но если мигания были заданы  на весь период автозапусков - то  реле могло и скончаться раньше времени...

что сейчас настроено на канал зелено-желтый и зелено-черный? В каком он значении?