Не срабатывает автозапуск, зажигание включает, реле срабатывает, стартер не крутит, сига Е96, авто камри 40 автомат.

Не зная ни подключений, ни настроек сигнализации ответом на вопрос

подскажите пожалуйста, куда смотреть? 

будет банальность: смотреть  на всё подряд. 

По  незапуску:

цепи запуска, цепи обхода иммобилайзера и их настройки.

По неоткрытию ЦЗ:

на то - каким образом при первичном монтаже было реализовано управление центральным замком.

Рекомендую не заниматься самолечением (может стать еще хуже), а  посетить установщиков. В идеале тех, кто производил монтаж в машину.