A93V2 нужно ли будет повторное обучение обходу ключа 2CAN+2LINv5 после обновления прошивки?

Если кан не обновлять то нет.

Для чего хочется обновить?

Именно прошивку can модуля хотел обновить.

Не факт что поможет, но иногда при постановке на охрану не срабатывает центральный замок, сигналка на охрану встает, но двери не закрываются, если еще раз нажать на красную кнопку брелка то ЦЗ срабатывает.

Какое авто?

RAV4, ключ, 2007

Можно обучить без разборки.... 

А еще лучше замки аналогом подключить

так там перемычку надо на время обучения поставить, как ее без разборки то поставить?

Никак. Поэтому подключить замки аналогом и забыть о проблеме

я правильно Вас понимаю что если обновлю прошивку CAN модуля, то обучение ключа придется заново делать?

да. И тут возможны проблемы ))