А с другой стороны, когда есть риск угона или происходит сам угон, то пусть лучше у меня вся приборка будет в ошибках чем не станет авто. Конечно блокировка не должна вызывать ошибок в авто, но делается она для того что бы авто не угнали, а тут каждому своё.

Зачем тогда в первом сообщении писали про тормоз? Попробуйте отключить датчики удара полностью и датчик наклона тоже полностью. Еще вопрос писали что антену переклеивали, откуда и куда и как проложен шлейф антенны? Просто на охране, когда авто не заведено, сигнализация не срабатывает? Использовали ли кан модуль при установке или все аналогом? Если использовали то какие настройки оставили а какие убрали в кан модули?
Хотя все происходящие очень похоже на проблемы со стояночным тормозом ну или с педалью стоп.

С утра когда авто глохнет и на брелок приходит информация об этом, значок тормоза появляется вместе с сигналами тревоги? То что модуль обхода не виноват это точно, авто бы крутило стартером но не заводилось. 

Сегодня делали авто Ceed SW 2013 год, проблем с замком не было (прошивка 3.1, блок К9)всё прекрасно работает, есть задержка в управлении замками, но не значительна, имитация сцепления как говорил, второй концевик смыкаем на момент запуска через реле. Все по кану видит, контроль двигателя тоже есть, только тахометр, а не генератор. Зажигание аналогом, ручник аналогом.

Поддерживаю, только сегодня делали сида 2013 года (механика), завершение резервирования поставили по охране и получили, закрываем двери ставим на охрану, авто закрывается через секунду открывается. Сделали завершение по закрытию двери, что получили выходим из авто, закрваем дверь авто ещё секунду работает глохнет, затем нажимаем на брелке закрыть авто закрывается. Все как бы работает по если ставить режим 2 в таблице, но стало не удобно.

Вопрос а кан модуль при подключении использовался или все и так по аналогу подключено? 
Если бы это было проделано педаль стопа не загоралась бы на брелке. У Вас происходит следующее: Вы заводите автомобиль с пульта, авто заводиться, затем сигнализация видит нажатую педаль стопа и авто глохнет и начинает орать так как сработка по зоне педали стоп. Проверьте сами каким образом у Вас подключен ручник к автосигнализации и есть ли в цепи подключения ручника диод, должно быть так:


Заместо оранжево-фиолетового провода на схеме, сине-красный от Вашей сигнализации. Для точной проверки, отключите контроль педали стоп и стояночного тормоза в кан модуле, замкните сине красный провод сигнализации с массой автомобиля и проверьте, попробуйте завести авто сидя в нем, будет глохнуть и орать или нет.

В Вашем случае в настройка кан модуля отключить опрос педали стоп и стояночного тормоза и подключить все это аналогово, проводами. Если коробка автомат то провод оранжево фиолетовой от сигнализации подключить к педали стоп, туда где появляется плюс при нажатие, а провод сине красный от сигнализации подключить к массе. Если коробка механика то оранжево фиолетовый от сигнализации не подключать никуда, а сине красный подключить к ручнику, отвязав его предварительно от штатной проводки диодом (в инструкции к сигнализации есть схема как это сделать).

Перед подключение обязательно проверить этот провод, цвет может отличаться. Зажигание (Блок ВСМ нижний левый горизонтальный разъём левая часть фишки) провод зелёный с серебренной полоской, на этом проводе появляется зажигание и не пропадает в момент старта, к этому проводу подключить тонкий желтый провод автосигнализации, а настройках кан модуля информацию о зажигание отключить.

Для того чтобы авто не глохло а продолжало работать, вставить ключ в замок зажигания мало, его необходимо повернуть до режима зажигания и нажать на педаль стоп, тогда авто отмаргает поворотниками и останется в заведенном состоянии. Проблема незавода с ключа это или иммобилайзер штатный ключ не распознает или блокировка автосигнализации. Какая цепь блокирована в вашем авто сигнализацией? Для проверки этого сядьте в авто, поставьте ее на охрану старлайном и пробуйте завести ключом, что будет происходить с автомобилем? Необходимо посмотреть как реализован обход штатного иммобилайзера в Вашем автомобиле, есть ли проводная антенна на замке зажигания?

Вот теперь решение есть и оно обязательно кому нибудь поможет. Спасибо за ответ, хорошо что все решилось хорошо.