Удачи и нормальных решений! 

Тогда скажите чем лепнина е96+м66 отличается от https://store.starline.ru/catalog/avtosignalizatsii/starline_e96_gsm_gps/. Вам никто не навязывает колхозный метод.Эти варианты исходят из вашего колхоза е96+м66. И причём здесь это https://help.starline.ru/x96/blog/2017/02/rukovodstvo-po-gibkoj-logike . Это для ознакомления , что можно делать такие простые вещи. Гибкая логика , для НОРМАЛЬНОГО  решения кто это понял и как это применить.

Так там и есть такой провод и ГИБКАЯ ЛОГИКА. А лепнина это Е96+М66.

Можно продублировать доп. каналом М 31 канал включения подогревателя на А 94.

Либо при достижении какой нибудь температуры включаем, отключаем котёл. 

Назначаем вход Е 96 на событие от котла. В лучшем случае М 66 может прислать только СМС. 

Брелок видит что прошла команда на включение котла (доп. канала) , а не то что он фактически заработал. А надо что-бы Е96 фактически увидел работу котла и сообщил М66 .А М66 покажет его каким-то событием в приложении.

Подогреватель запускается с пульта, при автоматическом запуске, НО не работает через приложение. Из всей найденной информации есть предположение, что нужно сменить канал подключения?

Кто не видит запуск подогревателя?  Вы написали что хотите работу отопителя через приложение. И каналы перебирать не надо. И задний проход здесь ни причём...

А автомобиль какой?