Да. Беда. Проверьте подключение к can шине. Не перепутаны ли провода местами? Также можно попробовать загрузить тестовую версию alpha отсюда:https://can.starline.ru/19/5/9013?firmwareId=265 с соответствующими подключениями.

И ещё для ознакомления: https://support.starline.ru/communities/7/topics/556-bmw-e90-slave

Если никак не заработает можно попробовать загрузить 1543. Вдруг повезёт.

А давайте начнём всё сначала.

Подключите can модуль к компьютеру с использованием StarLine-Master. В этой программе верните заводские настройки can модулю. Затем в меню "настроить" программы выберете свой автомобиль. Проконтролируйте наличие галок на SLAVE. Обычно по умолчанию галка уже стоит. Затем запишите застройки в can модуль. Опять выберете "настроить" и убедитесь, что все Ваши настройки сохранены в модуле. Далее кнопка "назад" и выход. Далее подключите сигнализацию к авто. Включите зажигание, откройте дверь и нажмите на брелке с дисплеем кнопку 3. Если на экране правильно отразится состояние автомобиля (открыта дверь, включено зажигание), то половину дела сделано. Если нет, то повторите выше написанное.

Займёмся сигнализацией.

При выключенном зажигании нажмите валет 9 раз, включите зажигание, дождитесь 9 сигналов сирены, нажмите валет 1раз, дождитесь 1 сигнала сирены, затем нажмите кнопку 1 брелка. 1 короткий сигнал подтвердит сброс на заводские установки. Выключите зажигание. Подождите минутку.

Нажмите валет 5 раз, включите зажигание, выберете AF на брелке, кнопку 3 длительно, кнопку 3 коротко.

Выберете функцию 11, поставьте в значение 1.

выберете функцию 22 поставьте в значение  4.

Выключите зажигание, дождитесь выхода из программирования.

Пробуйте работу сигнализации.

Давайте отделим мух от котлет. Вы пишете  я его с коробки поставил на машину. Его, это кого? У Вас в заглавии написано Старлайн а93 2can 2 lin. Это сигнализация с установленным внутри модулем 2 can 2 lin. Верно?

Значит: берём маленькую крестовую отвёртку, разбираем блок сигнализации. И вот там будет отдельная плата, установленная на штырьках над основной платой. Это и есть 2can модуль. И в данной маленькой платке будет присутствовать разъём микро usb. Далее компьютер, программа, шнурок, итд.

https://help.starline.ru/slm/ru/skachat

С брелка не входит в режим программирования потому, что не видит включённого зажигания. Если модуль 2CAN-LIN не чистый, то код должен принять. После того, как войдёте в режим программирования (4 длинных сигнала) нужно нажать на валет 1 раз, дождаться одного писка сирены, потом вводить номер авто. Про это не забыли?

Не хотите врезаться в силовой провод, тогда самое надёжное всё таки вскрыть дверную обшивку и добраться до кнопки. Там уже увидите, какой сигнал с кнопки и какая его полярность. Так же это можно отловить в жгуте, выходящем из двери водителя. Только с помощью пробника или тестера в режиме замера постоянного напряжения, а не сопротивления. По поводу Вашей поломки: всё таки проверьте ещё раз предохранители. Явно же отключилось где то постоянное питание.