Про ошибки Вы ни чего не писали.

Когда запрашивает ошибки то да.

А пробег и топливо он смотрит.

что за система?

Я за время "борьбы" с S96 успел подружиться с региональным представителем StarLain

Так в чем проблема, с ним и порешайте.

Давайте доведем до ума карту установки и логи настройки.

Меня как-то карты установки и настройки не особа беспокоят. Я думаю как и других профессиональных установщиков.

Поверьте и у пандоры, гемороя тоже хватает. Данный продукт для опытных установщиков, когда он появился на рынке у меня тоже не все получалось.

У Вас просто машина не распространенная и проблема не ординарная, вот и нет ответа.

Путем аналого подключения и настройки гибкой логике возможно все.

Может попробовать авторизацию отключит.

А что говорят Вам там где ее устанавливали?

Сделать сработку сигнализации, она до Вас дозвонится?

Попробовать перегрузить систему, путем снятия клемм аккумулятора.

Во время опроса модулем CAN информации БК зависает.

CAN модуль информацию с шины не запрашивает, он просто смотрит что в шине.

Если управление сигнализации подключено по кану, то тут могут быть команды которые тупят БК.

В Вашем случае выход один , пробовать управление переносить по аналогу, а не по кану (можно по очереди каждую функцию, может какая-то одна дает помеху).

Старлайн наверно пошел по пути , меньше кнопок , меньше вопросов, меньше проблем, простота эксплуатации.

Возможно это и к лучшему. Пользователи после того как наиграются, используют функционал устройств на 10%.

Уведомление о потери связи через приложение не приходит.
отображает, что в сети

Уведомление не придет, она у Вас в сети.

не открывает, предлагает послать смс.

Не открывает, потому-что интернет плохо работает (GPRS у старлайнв 2G), команда не проходит (за определенный интервал времени).

в зоне уверенного приема сотовой сети

Наличие сотовой связи - не показатель  качества работы GPRS 2G.