Выбирал я не сам.

Не готов обсуждать это... Плохо, что не сами...

На драйве видел, что на подобные авто ставили подобные сигнализации (e96 v2, но с gsm. Думал, что в них разницы нет, кроме наличия доп модулей

Увы - это очень разные сигнализации...

Вы хотите сказать, что мои вопросы очень просты и должны быть сходу понятны любому человеку, знакомому с электротехникой?

Я хотел сказать, что это замечательно, что у Вас стали возникать такие вопросы. Однако   заполучить ответы на такие вопросы можно  (и нужно) не за пару минут и даже не за пару часов. У меня ушло четыре года техникума и пять лет института, когда я понял, что мне катастрофически не хватает знаний для продолжения заниматься радиолюбительством. Причем оба учебных заведения были времен социализма. А тогда учить умели...

Все теперь отлично работает!

Ну и славно. 

Натолкнули меня на правильный путь.

Ну натолкнул нас  вообще-то Ё-Моё еще день назад...

А если пальцем на кнопку, то программной нейтрали я так понимаю что тоже нет.
а Вы попробуйте ...

При  пониженной громкости  звуков сопровождения постановок-снятий охраны такое  (зависимость издаваемых звуков от температуры) иногда наблюдается. Неисправностью это не является. При  полной громкости такого быть не должно. 

посетите установщика - на ГЛ дозапирание написать чтоб команда постановки проходила уже после выключения зажигания дополнительно.

я так понял - это уже реализовано, но почему-то не устраивает владельца...

В общем: Специалист технической поддержки сказал, что версия can, находится в стадии разработки 

Спасибо, что сообщили о причинах. Значит не для всех версий E96 "допилили" обход иммо.

и мне тупо не повезло.

Бывает. Издержки САМОустановки и САМОвыбора модели сигнализации....

Производитель  готов учить   АЗАМ основ электротехники и электроники (если кто-то физику прогуливал и в техникумах-институтах не учился, а потом угораздило в установщики податься),   а также нюансам и особенностям своего оборудования, но не в рамках этого форума.

Азбука установщика

https://www.starline.ru/wp-content/uploads/2017/02/azbook.pdf

в помощь 

и это https://www.starline.ru/2018/meropriyatiya/starline-obuchaet-4/

и  обучающие вебинары в помощь. Например  из последнего

Если прямо в поисковике набрать "вебинар старлайн" - будут еще видосы.

Но выкладывать свои  схемотехнические и программные  наработки в свободный доступ - это вряд-ли.

обратился, не поверите, но посылают к вам, т.к. схем установки на данную комплектацию НЕТУ, как и писал ранее

В смысле "посылают к Вам"???

То есть ВЛАДЕЛЬЦА посылают к производителю? ЗАЧЕМ? За схемой подключения к данной конкретной машине?

А они точно УСТАНОВЩИКИ? Или они мастУры-проводокруты по картинкам  из интернета?

Может Вам стОит поискать ДРУГИХ установщиков? Настоящих?

Поискать  таких, которым  картинки из интернета не требуются, а достаточно:

а) машины ВЖИВУЮ в установочном боксе

б) набора инструментов для разборки салона для доступа к проводке

в) набора измерительных приборов для поиска в проводке машины необходимых для установки цепей...

Попробуйте поискать таких установщиков тут http://www.starline.ru/x96partners/

В крайнем случае - техподдержка не отказывается консультировать УСТАНОВЩИКОВ и через этот же форум и по телефону и даже присылать им в установочный бокс РЕГИОНАЛЬНОГО  представителя  фирмы (по совместительству очень грамотного установщика). Но  ТОЛЬКО ПРИ ИХ ОБРАЩЕНИИ, без  посредничества владельца машины...

Похоже те, к кому Вас занесло -  просто не хотят возиться с неизвестной им машиной. Хотят легких денег и по-простому...

Ответ на этот вопрос очень прост, потому что StarLine располагает всей необходимой технической документацией на свой продукт. В данном случае, проще спросить и получить точный ответ, чем измерить.

По  поводу  узнать у производителя читаем

https://support.starline.ru/knowledge-bases/2/articles/19670-pravila-foruma п.3.3.

В момент глушения мотора подготовленной к запускам машине слишком много чего "гуляет" по шине CAN и она ЗАНЯТА этими пакетами данных штатных систем. Сигналка "золушка" не может вклиниться в этот перезвон между "мачехой" - главным блоком на борту  и её "дочками" - другими штатными блоками.

Подробности  про шину CAN тут https://www.alarmforum.ru/forum55/thread15807.html (самое интересное - на стр 3 и 4)

Поэтому решение 

 Если использовать гибкую логику и сделать паузу в пару секунд между глушением и постановкой в охрану то тоже все хорошо (поворотники 2 раза моргают) и штатка стает в охрану.

одно из возможных (а возможно и единственное)...

Вопрос или просьба можно ли сделать так, чтобы всегда при глушении машины с брелка штатная система вставала в охрану (без гибкой логики, без открытия и закрытия)?

Можно попробовать. Но не факт.

Есть ли в StarLine E96v2 настройка задержки между глушением двигателя и постановкой в охрану? 

Есть.  Через StarLineМАСТЕР в разделе "запуск двигателя" в подразделе "адаптация к автомобилю" в пункте "задержка постановки штатной системы охраны после остановки двигателя" попробовать сделать задержку 2-3 сек.

НО  в описании этой функции написано, что она касается только  завершения  автозапуска/дистанционного пуска, а также турботаймера. Про завершение программной нейтрали ничего не сказано...

Экспериментируйте - потом напишете - получилось или нет.

Или нужна доработка прошивки?

Прошивку на снятую с конвейера машину вряд-ли уже кто-то будет дорабатывать.