Значит надо проверить ,залить опять 3.0... И потом в техподдержку доложить. Ну я бы так сделал. 
А почему 2.5? И еще вопрос сам программатор давно обновляли (программу)?

Кан тормозит???)))  

Если у Вас стоит радиореле его тоже надо будет перезаписать. Узнаете просто ,если после перезаписи брелков авто не будет заводится (или будет глохнуть) - у Вас есть Р2. 

Строго по инструкции...И перезаписывать надо оба брелка. Радиореле у Вас стоит (Р2)?

Да ,с брелка . По умолчанию может быть мало...Поставьте 8-9 для начала.

Не должна срабатывать от открытия через приложение...Радиус метки у Вас на сколько стоит? А по поводу того что штатный брелок не работает - это к авто вопрос ..Просто проверьте когда зажигание включено штатный ключ не работает...

Можно ЛС писать....ну во всяком случае пока можно...

В гибком программировании каналов 2 последних пункта - игнорирование ДУ и игнорирование концевиков.. db- это двери дальше on или off

Я в личку напмсал на Фортине...))

Про наводки - это вы зря ))). Попробуйте сделать контроль по "шумам" и выключить контроль из КАН. Если наладится - делать контроль по аналогу.