С дополнительного канала автосигнализации (предварительно запрограммированного), подать импульс на концевик водительской двери, если мощности доп канала на прямую не хватит, то через реле подать этот импульс на концевик. Возможно после этого не будет управления центральным замком по кан шине, если управление у Вас именно от туда (придётся делать открытие по аналогу), ещё могут открываться замки дверей после подачи импульса на концевик водительской двери (надо будет дозакрывать замки с доп канала например). Надо пробовать.....

Пробуйте, потом напишите результаты.

Слейв режим на Вашем автомобиле ранее работал или он с самого начала у Вас не работает (не включён)? Причина такого поведения может быть и поиск метки после снятия авто с охраны, но это происходит при активном слейв режиме.

Тогда думаю отключение альтернативного управления не дадут результатов. Вопрос: контроль зажигания тоже взяли в кан модуле? Если да то для надёжности отключить бы этот сигнал в кане и подключить тонкий желтый провод сигнализации к зажиганию (например туда же куда Вы подключили толстый желтый провод силового модуля от сигнализации). Это просто совет, если работа системы стабильна и не вызывает проблем, то пусть все останется как есть. 

Вы же не подключали провода автосигнализации для альтернативного управления замком и аварийкой (зеленый и синий)  к штатной проводке автомобиля? У вас управление центральным замком происходит по кан шине, так? Если так то думаю отключение в настройках кана альтернативного управления замками и аварийкой не помогут. Пробуйте поставить в модуль прошивку другой версии, та которая ниже чем 3.1 (начните с 2.3) Или переподключать центральный замок по альтернативному управлению, к штатной кнопки.

Карта носит рекомендации по монтажу, все необходимо проверять (причин для этого хватает, комплектация, сборка, изменение цветов в штатной проводки, года выпусков и многое другое). По поводу центрального замка, какая прошивка у кан модуля? Если не самая свежая, то необходимо обновить, сделать это можете самостоятельно (возможно это поможет, если нет то надо будет пробовать разные версии прошивок). Центральный замок изначально так срабатывал или раньше не замечали?

Ошибки не отвиснит? Блокировать под сидушкой?

Пожалуйста, не забудьте проверять точки подключения перед тем как что-то туда подключить.

В чем была проблема? Как спросить про проблему так всегда пожалуйста, а как сообщить результаты решение этой проблемы можете не ждать, не красиво так. Проблема озвучена была, надо бы решение.

Для корректной работы Вашего авто Вам необходимо в настройках кан модуля отключить контроль зажигания, контроль педали тормоза, контроль стояночного тормоза, все эти сигналы подключить аналогом к Вашему автомобилю. Для надежности всей системы можете даже контроль заведенного двигателя в кан модуле отключить и подключить аналогом провод серо черный тонкий от автосигнализации к тахометру на диагностическом разъеме, но это не обязательно. Желтый тонкий провод к зажиганию в автомобиле, оранжево фиолетовый тонкий к педали стоп сигналов (я так понимаю это у Вас сделано), сине красный провод тонкий подключить к массе автомобиля (это у Вас тоже сделано как я полагаю).

Для открытия багажника ели я не ошибаюсь небходимо желто черный провод доп канала подключить к штатной кнопки и запрограммировать импульс секунды 3, куда подключаться точно не помню надо смотреть, интернет в помощь.