Первый раз обновлялся через SMS команду, проверьте, может есть ошибка в этом случае.

Это коммерческое ПО, а не поделки школьника на коленке (я надеюсь) и обновление не должно приводить к тому что систему нужно настраивать заново. Но это мое мнение как пользователя, а также как разработчика других коммерческих проектов, оно может не совпадать с Вашим.

Съездил к установщикам - сказали что все настройки были сброшены (странное поведение при обновлении если честно). Настройки восстановили и все заработало, даже лучше стало, раньше при автозапуске открывались двери, заводился двигатель и двери закрывались. Теперь двери не открываются на время запуска. 

В новой версии ПО добавлена возможность игнорирования тревоги штатной сигнализации в настройках системы.

Это только через StarLine Мастер настраивается? Могу я посетить ваш фирменный центр для настройки или нужно ехать туда где ставили?

Супер, уже лучше, пока подожду может что скажут инженеры StarLine

В версии 2.25 появилась такая известная ошибка, вот думаю не мой ли это случай

1. 2.25.X GEN7 E96 BT E96(V2) S96(V2) Иногда во время автоматического или дистанционного запуска не отключается НР блокировка