в моём случае помогло, мне подсказали 

вопрос решен. Дело в просевшем аккумуляторе и сопротивлении на имитацию педаль тормоза в 1 кОм.

Поставил сопротивление в 500ом на имитацию тормоза и старт стоп кнопку. И все работает.

Решил вопрос не сам мне подсказали 

Привет, у меня такая же беда, если решил вопрос то поделись.

Мои мысли в имитации тормоза, т.к когда я пытался запустить она делала такие же действия как описываешь ты. Сел нажал дополнительно тормоз и она запускает. 
Хотя видно что система сама тоже выжимает тормоз во время запуска.

Обход у меня сделан подачей 3.3в на ключ, видит она его всегда как надо.

Импульс ставил и 1 и 2 сек.

У меня f30 320d 2013г.

Ставил товарищу на f30 320i 2013г у него все работает.

Обе s96 v2  ставил оба я. У него все норм у меня нет)