Спасибо. 

Нештатных устройств не установлено на автомобиле, но только если в прикуриватель usb адаптер.

Пробовал отключать клемму от аккумулятора, подцеплял другую антенну(которая на лобовом стекле)  безрезультатно. Также заметил когда возникает такая ситуация с сигнализацией, мой второй авто(установлена сигнализация Jaguar EZ-ONE) также не хочет открываться с пульта.

Как будто моя сигнализация перебивает сигнал во время этого глюка. Как только удается снять с охраны мой авто, второй тоже без проблем открывается с пульта.