Функция запирания после остановки двигателя включена. Включена она для того чтобы, дозапирать штатное открытие замков после остановки двигателя. 

Возможно для закрытия окон достаточно будет добавить запирание после остановки двигателя.

Автоматическое управление замками отключено

Нужно проверить настройки автоматического управления замками в первой таблице настроек.

Тот кто устанавливал сигнализацию находится в 3000 км от автомобиля