Похоже проблема действительно в концевиках, но очень странно. На других дверях не проверял. Проверял пока что только на водительской. Если открыть дверь, то машина (а следовательно и сигнализация) видит открытие двери, но не сразу, а с какой то задержкой. Видимо когда я быстро сажусь в машину, машине не понимает что я сел в машину. Попробую заменить концевик у дилера, по результатам отпишусь.

Я тоже склоняюсь к подобному варианту. Просто подумал, что может есть какие-нибудь настройки в данном направлении.

Большое спасибо за помощь.

Машина видит что дверь открывается (загорается индикатор на приборной панели), а сигнализация нет? Тем более индикация лампочки (сигнализации) дает понять, что сигнализация тоже видит открытие двери. 

Заметил следующую ситуацию. Если после автозапуска, сесть в машину и не нажимать тормоз, то машина встанет на охрану. Если выжать тормоз, то все работает исправно. 

99% что проблема в логике сигнализации. 

p.s: так же есть глюк по сигналке если оставить ключ в замке зажигания. Машина встает на охрану, ты понимаешь что забыл ключ, пытаешься открыть двери, но сигнализации не реагирует на брелок, пока не заорет  и не поорет пару секунд, в машину тебя не пустит.