Почитать инструкцию не?

http://help.starline.ru/e96/ru/instruktsiya-po-ekspluatatsii-e96-vt-e66-vt/upravlenie-komleksom-s-pomoshch-yu-metki

Тогда поставлю вопрос по-другому. Как нужно настроить гибкую логику

Вы бы у своих установщиков это спросили,они должны знать.Если не знают- дайте посмотреть эти настройки Индикация ДЗ.slc

 Как зациклить индикацию?

Второй программой,у которой событие будет "Программа 1/Завершение работы" и в первую программу добавить событие "Программа 2/Завершение работы" - так индикация будет работать до наступления события выключения в какой-либо из этих двух программ.

Завязывай уже бухать,клоун.

Удалённо нет.

в каком формате отправляется команда на запуск двигателя по расписанию - смс или GPRS?

Это настройка центрального блока.Отсюда вытекает и ответ на второй вопрос:

А  если команда на запуск по расписанию не прошла (машина в боксе нет сигнала GPRS) дублируется запуск каким нибудь образом?

Наличие связи никак не влияет на включение дистанционного запуска по расписанию.

Верхний скрин - программа настройки центрального блока,нижний - веб-сервис.Вот ещё скрин из мобильного приложения

На всём 6-ом поколении доступен этот функционал.В этой теме разговор идёт в таком ключе,что производитель полностью игнорирует просьбу предоставить пользователю возможность настроить запуск по расписанию,вот я и заметил,что это уже давно есть,нужно только тщательнее подходить к выбору системы с требуемым функционалом.

Вам,видимо,так нужен этот функционал,что даже не соизволили поинтересоваться.

Я бы предложил для начала обновить ПО центрального блока http://help.starline.ru/a96/ru/programmnoe-obespechenie/osnovnoj-blok и загрузить индивидуальную прошивку CAN для авто(установщики выбрали из общей библиотеки).Индивидуальная прошивка доступна по той ссылке,что приводил выше,загружается в блок так же через кнопку "Обновить прошивку".После загрузки индивидуальной прошивки в настройках нужно будет выбрать авто.Возможно потребуется пройти заново процедуру обучения обхода иммобилайзера.