Хотя насколько я помню на всех сигналках сначала загорается панель приборов как будто ключ повернут в первое положение, бензонасос накачивает систему и уже через 3-4 секунды происходит запуск.

кнопка старт-стоп ... Вы как машину запускаете ( нажали кнопку один раз - бензонасос накачивает систему - нажали стоп и кнопку ) ?

и

 моргают несколько раз габариты,

габариты и Ford Focus 3 = странно ...

3. После дистанционного запуска открываю машину штатным брелком завожу машину и светодиод начинает медленно моргать как в режиме постановки на охрану и перестает мигать

Изменения в ПО Q6:

1. Устранено "моргание светодиода" после снятия с охраны (Slave без авторизации) с автоматическим глушением двигателя (SF#17=2,3,4).

разговор можно растянуть на неделю - проще доехать до установщиков ( любых ) . похоже концевик от сиги подключен к салонному фонарику - сброс настроек не делали - акб полностью не садился ?

в первую секунду машина на охрану ставится, но потом начинает орать сирена со всем остальным цирком

говорите точно в секундах через скока начинает орать

Ставили сигналку в сертифицированном Вами центре в Москве (не от старлайна). 

интересно - кто это Вами ?

В октябре 2017 поставили Starline A93 2CAN 2LIN GSM (обходчик Fortin)

снять  Fortin - подключить согласно этого .

если надпись SAFE не беспокоит .

снимите видео

снимаете с охраны штатным брелком ( ключем ) ?

Включен только CAN "полная библиотека из прошивки"

а не 7118 ?

перепроверить установщиков

блок снят - Вы можете проверить только настройки кан модуля , для блока нужен программатор или вручную через программирование .  проверьте разъемы на блоке ВСМ над левой ногой .