"В случае тревоги система Вам звонит?"

Нет, звонка нет, sms тоже нет.

Поставил автомобиль в режим охраны, через минуту открыл дверь, сработала сирена.

"В какой момент система перестала выполнять команды через звонок и приложение?"

В момент когда перепрограммировали модуль GSM на нового владельца.
Производилось про инструкции где нужно отомкнуть модуль отдельно и на определенные пины с определенным интервалом подать напряжение. Процедура была проделана и модуль обнулил мастер телефон, зарегистрировали телефон М1 нового владельца (меня) и установили модуль обратно.

"В случае тревоги система Вам звонит?"

Не проверял, обязательно сегодня проверю и отпишусь

В дополнение к вопросу, может нужно будет...

Команда 09 
VER:C8

GSM:31(A)

BAT:12.57V

MCC:250

MNC:01

LAC:02B2

CI:9FAA