Your comments

надо поэкспериментировать.

Получается да. Обходчик полностью не заменяет реальный иммобилайзер. И 16 пин тут нафиг не нужен

16 пин слота нигде не указан

Возможно нужно реализовать сигнал"ключ в замке" чтобы при АЗ/ДЗ не горела ошибка

После установки автозапуска на Passat B6 sedan 2009 не работает slave - штатным брелоком не ставится в охрану. Также не запираются задние двери при постановке в охрану брелоком Старлайн(через раз, а то и вообще невозможно закрыть) Прошивка бета. Без автозапуска все работало корректно. Что нужно изменить в настройках чтобы все это исправить?

Да работает и полностью функции работают starline e96 Passat B6 2009г.Устанавливал впервые и для себя, комментарии пользователей мне очень помогли. Обсуждение есть ещё и здесь :  https://support.starline.ru/communities/80/topics/40065-vw-passat-b6-2005-2010-beta-versiya

Прошивка только для шестого поколения если не ошибаюсь

Тогда нужно ещё раз в все внимательно перепроверить,продернуть, перезвонить. Если бы не обходчик иммобилайзера не прописывался, это ещё ладно, но чтобы сигнализация срабатывала , скорее всего ошибка при монтаже. Удачи!