Оба провода идут напрямую с аккумулятора, поэтому просадка связана только с самой платой.

на колодку, отсоединенную от платы, приходит 12В, а вот на плате на входе платы они уже превращаются в 3В.

коротит не в ноль, конечно. Это мое предположение, основанное на том, что на контактах вместо 12в имеется только 3в и это на входе. Думаю, что это не нормально.