Вон оно как, не видел таких прошивок, извиняюсь!

Вы наверно не совсем поняли вопрос? как можно провод контроля ручника посадить на массу на авто с механикой???

Скорее всего это неправильная блокировка, как Вам уже написали, уточните, где Вам ее сделали? либо когда искали где ее сделать, такое могло быть! 

если все по аналогу, подключение ц.з с блока управления в двери водителя, концевики дверей бязательно через 2 диода!! (возможно здесь проблема), после датчика удара авто точно заводится с Е90,  может при выкл тревоги у вас происходит запирание или отпирание ц.з, после этого загорается салонный свет и сигналка видит открытие дверей(опять же это из-за неправильного подключения концевиков) без асс климат работает на установленном режиме, без вкл магнитолы, по поводу штатки: под капотом либо с доп канала либо с блокировок сделать отпирание капота на время запуска, можно конечно навсегда (так делают некоторые) замкнуть концевик капота на массу - тогда штатка не работает совсем!!! сработки не будет, проверять после резервирования через 5-7 мин. Удачи!

В старых прошивках кан есть только стекла (помоему 2.1 прошивка), повторюсь:  при правильном подключении модуля обхода иммобилайзера (куда подключен "+") в вашем случае скорее всего подключили к зажиганию, но если конечно все правильно, то для удаления проблемы со штаткой,  нужно имитировать открытие капота на период автозапуска, методов много(доп каналы, выход блокировки, провод состояния и т.д.)

в кан модуле зеркала отключить, складываться не будут, остальное всё работать будет. для нормального запуска с доп канала подать минус на концевик капота на время запуска - аналогом

обратитесь в диллерский цент, с помощью диагностического оборудования вкл штатку, все будет хорошо

зажигание по аналогу (вход, тонкий желтый провод)

Функция 15-2(завершение резервирования закрытием двери, там тоже мкпп), но заглохнет авто сразу как сработает концевик двери, после этого нажимаешь 1 кнопку, и авто закрывается исправно

в прошивках начиная с 3 не совсем корректное распознание ручника, обнови на 2.7, там всё корректно, данную информацию обрабатывают специалисты, по поводу багажника - включи штатку при отпирании ц.з. если нужен багажник при вкл зажигании, то аналог!