VW Tiguan, 2010 - 2016 (NF)

Самое разумное - чтобы не стало еще хуже - посетить установщиков (желательно не первых встречных, а поискать тех, что  ПОГРАМОТНЕЕ). Чтобы они всё восстановили. Потому что тыкать настройки наобум, не зная - что-куда, а главное ЗАЧЕМ из входов-выходов сигнализации подключено к проводке машины и что взято из CAN, а что сделано "по аналогу" - нередко ПУТЬ В ЕЩНЕ БоЛЬШИЕ проблемы...

Теперь ответы на Ваши  вопросы:

двигатель не заводится из мобильного приложения. 

Потому и не заводится, что

после обновления модуля CAN на 6.3 перестал работать обходи штатного иммобилайзера

обновление ради обновления-  это путь в проблемы. Сигнализация -  это не айфон - она не сама по себе. Она ВНЕДРЕНА в машину и составляет с ней единое и неделимое. И обновление одного без обновления другого  - это  ... путь в проблемы...

программатор нужен для copy key или через starline master делать?

Нужен ... ИНТЕРНЕТ . Ну и StarLine МАСТЕР, который "попросит помощи" у ... СЕРВЕРА фирмы Ультрастар, который поможет вычислить код шифра ЧИПа из ключа машины, прочитанного на первичном этапе в автомобиле (14 валетов, зажигание и т.д.).

до этого обновления вск работало.

При обновлении Вы снесли всю инфу из CAN-модуля. В том числе и сохраненый ШИФр ключа , который был  в той прошивке, что стерли...

а где этот кан модуль?

В сигнализации

А чегоже нигде не написано что слетает обучение. я не полезбы никогда

Ну так это общеизвестный факт, про который перестали писать  на каждом заборе давным давно, чтобы не обижать УСТАНОВЩИКОВ,  обижая  их намеками  на их некомпетентность. Ведь понятно, что СНОС ПРОШИВКИ CAN-модуля - это полное уничтожение всех данных, которые в нем хранятся... Вроде очевидная вещь для любого программера. Но это не всё - НОВАЯ ПРОШИВКА нередко содержит другую СТРОКТУРУ программного кода, не совместимую со структурой старых версий прошивок. И поэтому ХРАНИТЬ ДАННЫНЕ о ключе ОДЕЛЬНО  становится бесполезно - новая прошивка не сможет ими воспользоваться... Проще ПЕРЕОБУЧИТЬ модуль CAN заново.

обучил и copykey прошел.

Уже хорошо.

но теперь двигатель запускается и глохнет 3 раза

Причин может быть несколько. самая частая - сигнализация теперь не видит. что она завела мотор... НО не единственная. Лучше всего - посетить установщиков ВЖИВУЮ.

Хорошие  - смогут найти и устранить ту реальную причину. по которой он так, как есть сейчас...